Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms