Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SOBPA7XYQ1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SOBPA7XYQ1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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