Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms