Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KRT87PA6NCN2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms