Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms