Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms