Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
U3KQ87 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
U3KQ87 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
U3KQ87 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms