Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAP3K4Q9Y6R4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MAP3K4Q9Y6R4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms