Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNX8Q9Y5X2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms