Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms