Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHTOPQ9Y3Y2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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