Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRELID3BQ9Y3B1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms