Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG6Q9Y2V7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COG6Q9Y2V7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms