Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POMPQ9Y244 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms