Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNQ9UQP3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNNQ9UQP3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms