Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHOC2Q9UQ13 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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