Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM35Q9UPQ4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms