Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRQQ9UMZ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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