Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms