Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPCN1Q9ULQ1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms