Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDRG4Q9ULP0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms