Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DENND2AQ9ULE3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms