Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF3Q9ULD4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms