Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGA2Q9UJY4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms