Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MLH3Q9UHC1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MLH3Q9UHC1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MLH3Q9UHC1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MLH3Q9UHC1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms