Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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