Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKLFQ9UBR5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms