Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
REREQ9P2R6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
REREQ9P2R6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
REREQ9P2R6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms