Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MARCH4Q9P2E8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms