Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MBD5Q9P267 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms