Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMG20BQ9P0W2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMG20BQ9P0W2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms