Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CWC25Q9NXE8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CWC25Q9NXE8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms