Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT57Q9NWB7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms