Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMLHEQ9NVH6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMLHEQ9NVH6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms