Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV70

EXOC1, Exocyst complex component 1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC1Q9NV70 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOC1Q9NV70 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms