Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAMSN1Q9NSI8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAMSN1Q9NSI8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms