Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUOX1Q9NRD9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUOX1Q9NRD9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms