Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms