Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RNU4-86P-201ENST00000410135 219 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SENP3Q9H4L4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 IL36G-201ENST00000259205 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 SPRR3-202ENST00000331860 985 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 LMO3-224ENST00000540848 1574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms