Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL3Q9H2J4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms