Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6AQ9H2E6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6AQ9H2E6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6AQ9H2E6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6AQ9H2E6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA6AQ9H2E6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA6AQ9H2E6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms