Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMIM3Q9BZL3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMIM3Q9BZL3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms