Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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