Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PUS3Q9BZE2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms