Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM54Q9BYV2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms