Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GSDMCQ9BYG8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms