Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABARAPL3Q9BY60 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPL3Q9BY60 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms