Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-6Q9BXR3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms