Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms