Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2AFJQ9BTM1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2AFJQ9BTM1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms